От създаването му през 1998-а досега на Фонда за гарантиране на влоговете му се е налагало да плаща депозитите в четири обявени в несъстоятелност банки.
В началото на1999-а започна плащането на депозитите в Кредитна банка и Балканска универсална банка, чиито лицензи БНБ отне в края на предишната година. Тогава гарантираната сума по влоговете бе в пъти по-ниска от сегашните 196 хил. лв. и се формираше стъпаловидно според техния размер. На някого днес може да му се стори странно, но изплащането продължи цели пет години, защото немалко клиенти на двете затворени кредитни институции не бързаха да си търсят парите. Така до 2004-а фондът плати на вложителите на Кредитна банка и на БУБ общо около 9.13 млн. лв. при общ размер на гарантираните депозити в тях от 9.82 млн. лева. С други думи, около 690 хил. лв., и то отчетени след деноминацията през 1999-а, останаха непотърсени от собствениците им. Интересен факт е и че специално в БУБ едва 20.4% от броя и около 63% от сумата на гарантираните влогове са били потърсени от титулярите на тези сметки.
В средата на 2005-а БНБ отне лиценза и на Международната банка за търговия и развитие. Общата сума на гарантираните влогове в нея беше 25.18 млн. лева. Тяхното изплащане също продължи цели пет години и причината отново бе, че част от клиентите не бързаха да предявят претенциите си. До средата на 2010-а фондът е платил по гарантираните депозити в МБТР общо 22.87 млн. лв., а 2.31 млн. лв. са останали непотърсени.
Последното плащане на влогове е на клиентите на КТБ. От 4 декември 2014-а до 13 август 2015-а общият размер на платените гарантирани депозити в тази банка е 3.65 млрд. лева.
