Николай Цонев осъди прокуратурата за претърпените от него вреди по първото дело срещу него – за четири сделки, сключени в нарушение на Закона за обществените поръчки, когато е бил шеф на дирекция "Управление на доставките" във военното министерство. Разследването първо беше прекратено, после възобновено, след което Цонев беше оправдан. В иска си пред Софийския градски съд (СГС) той е поискал 50 хил. лв. компенсация за неимуществени вреди с мотива, че делото му е причинило силен стрес и се е отразило негативно на политическата му кариера. Първата инстанция му присъжда обаче 30 хил. лв. обезщетение за неимуществени вреди с мотива, че е със стабилна психика, продължава да преподава в два университета и е лидер на партия "Нова алтернатива". СГС присъжда на Цонев и 10 хил. лв. за имуществени вреди във вид на разноски по делото. Софийският апелативен съд (САС) пък намалява още обезщетението за неимуществени вреди, свеждайки го до 15 хил. лева. Въззивната инстанция отчита обстоятелството, че през 2002-2003 г., когато са сключени сделките, Цонев не е бил публична личност и до възобновяването на разследването то не е било обект на медийно отразяване. Съдът признава обаче, че след възобновяването, когато той е вече министър, срещу него е воден показен наказателен процес.
