Двама души ръководят агенция Митници. Това са назначеният през седмицата директор Кирил Желев и заместникът му Николай Попов. Попов отговаря за дирекциите Митническо разузнаване и разследвания, Последващ контрол и Централна митническа лаборатория.
Всички останали дирекции са на пряко подчинение на Желев защото независимо че по щат агенцията трябва да има трима заместник- директори, две от местата все още са вакантни. Що се отнася до Борислав Борисов, който бе временно изпълняващ длъжността на Агенция Митници, докато Ваньо Танов бе в болница, той остава на работа в агенцията, но все още не е ясно на каква длъжност. Самото назначение на Желев не бе неочаквано. Той има сериозен опит в сферата на държавните финанси. В 37-ото Народно събрание е бил председател на Комисията по бюджет и финанси. От септември 2007-а до май 2009-а е заместник-министър на финансите с ресор данъчна политика и приходни администрации. През май 2009-а е избран за член на Комисията за финансов надзор и остава на този пост до юли 2010-а, когато управляващите от ГЕРБ промениха закона и смениха цялото ръководство на КФН.
Първоначално името на Желев се спрягаше за заместник финансов министър, но ако той бе назначен на тази длъжност, сега управляваното от Петър Чобанов ведомство щеше да има за заместник-министри трима специалисти по приходите и нито един заместник, който да е експерт по разходни политики. Впрочем такъв и в момента липсва. Затова според лица посветени във взаимоотношенията по висшите етажи на изпълнителната власт, разходните политики в бюджета за 2014-а ще се изготвят директно в кабинета на премиера Пламен Орешарски с активното съдействие на съветника му Кирил Ананиев – бивш заместник финансов министър и специалист по бюджетни разходи, и на сегашния заместник финансов министър Людмила Елкова.
