Министерство на отбраната ще се ръководи от председателя на ВМРО – Българско национално движение (ВМРО-БНД) и съпредседател на Обединени патриоти Красимир Каракачанов, който ще контролира и силовите ведомства като вицепремиер. Той е на 52 години, завършил е история в СУ "Св.Климент Охридски", специализирал нова българска и балканска история. Каракачанов е бил депутат в 39-то и 40-то Народно събрание. Заради политическата си дейност като лидер на ВМРО, през 2007 и 2008 г. той получава три писма със заплахи за смърт. През 2007 г. Каракачанов е огласен от комисията по досиетата като агент "Иван" на Шесто управление на ДС за борба с идеологическата диверсия. Вербуван през май 1989 година, като студент ІІІ курс. Използван е по линия на "промакедонския национализъм". Заради агентурното му минало експерти предполагат, че в качеството си на военен министър Каракачанов може и да не получи допуск до секретна информация на НАТО.
